Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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