Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPRL3Q12980 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms