Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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