Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms