Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SMARCB1Q12824 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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