Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TROQ12816 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TROQ12816 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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