Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms