Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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