Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms