Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms