Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms