Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FMODQ06828 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms