Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.8 ms