Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD51Q06609 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms