Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMX2Q04743 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms