Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms