Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMF1P82094 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1125.5 ms