Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX3P78415 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX3P78415 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRX3P78415 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms