Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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