Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms