Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AIF1P55008 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms