Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms