Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPAP53621 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPAP53621 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms