Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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