Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms