Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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