Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A1P43005 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms