Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HOXD13P35453 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HOXD13P35453 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HOXD13P35453 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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