Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRABP1P29762 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms