Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO2P25791 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMO2P25791 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMO2P25791 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms