Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL9A1P20849 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms