Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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