Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms