Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM21P19474 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms