Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms