Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms