Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYL4P12829 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYL4P12829 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYL4P12829 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms