Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNAP12004 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNAP12004 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms