Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SYCP3-201ENST00000266743 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LIPT1-201ENST00000393471 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC009078.1-201ENST00000474978 783 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC00635-207ENST00000488852 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A52-201ENST00000269205 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC074033.1-201ENST00000418623 410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ARHGEF38-IT1-201ENST00000512262 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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