Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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