Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX11BO96011 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms