Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL2O75678 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms