Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms