Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAB2O43741 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms