Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PHF1O43189 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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