Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms