Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms