Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL33A6NCF5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms