Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms