Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX49Q9Y6V7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX49Q9Y6V7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms